En el ámbito de la ciudad, hay una serie de lugares donde hay más probabilidad de propagación de microorganismos patógenos como la concentración de personas, zonas de preparación y consumo de alimentos con los gérmenes propios(por ejemplo, salmonela) y lugares de alto nivel de humedad como son los WC, duchas, saunas ,etc., por la fácil proliferación de colonias de hongos, para evitar una excesiva proliferación de microorganismos en estos lugares se emplea la desinfección.

Como medida preventiva en éste campo se deben emplear productos de amplio espectro de actuación contra virus (Hepatitis...), bacilos (Koch tuberculosis), bacterias Grahm positivas o negativas, Salmonellas, esporas hongos, gérmenes aerobios, anaerobios, micrococos, estafilococos, estreptococos, etc. Del mismo modo el tratamiento debe realizarse con productos que no dejen residuos tóxicos y no sean corrosivos pero sí eficaces viricidas, bactericidas y fungicidas a base de componentes eficaces, poco contaminantes y aplicados por profesionales.

Y se aconseja cumplir una serie de normas también de prevención ya que esta es fundamental en todo tipo de lucha contra agentes patógenos:

· Separación de circuitos limpios y sucios.
· Evitar mezclar las materias primas con los productos ya elaborados.
· Reducir al máximo la manipulación del producto
· Utilizar personal manipulador cualificado y profesional.
· Un entorno de trabajo limpio y desinfectado.
· Utilización general y precoz del frío (0ºC-4ºC), siempre que sea posible.

Para conseguir desinfectar y desodorizar todo el recinto, lo más adecuado es una desinfección de superficies por vía aérea (atmosférico). Se logra de esta forma acceder a todas las áreas de una forma sencilla, cómoda y rápida.

Otro capítulo muy importante en la desinfección la ocupa los Servicios Higiénicos Sanitarios, es decir, los contenedores para compresas y tampones así como los pañales de los bebés. Elementos éstos contaminados con Bacterias, muchas de las cuales son patógenas esto es, pueden dar lugar a enfermedades en los seres humanos y adicionalmente producir olores desagradables. Una forma de prevenir problemas es la ubicación de unidades que cumplen la doble misión recolectora y esterilizadora, al que hay que acompañar con un buen servicio de reemplazo, esterilización y mantenimiento. Unos recipientes que disponen de una trampilla que permite la introducción de los elementos higiénicos impidiendo el acceso o visualización posterior de los mismos. En el fondo se deposita un líquido con propiedades antibactericidas y perfumadas que desinfecta y esteriliza el contenido. durante un período que varía según su uso pero que oscila entre 15 a 30 días.